تعليقا على استهداف بعض الجماعات الإرهابية للمساجد أكد معالي وزير الأوقاف أ.د/ محمد مختار جمعة على استنكاره الشديد لذلك ، وذكر أن ذلك يرجع إلى التوظيف السياسي للدين والمتاجرة به لتحقيق مصالح حزبية أو طائفية ، وأنه يجب إبعاد المساجد ودور العبادة عن أي صراعات سياسية أو حزبية أو طائفية ، فالمساجد لما يجمع ولا يفرق ، فينبغي أن تكون وجهتها خالصة لله وحده ، ” وَأَنَّ الْمَسَاجِدَ لِلَّهِ فَلَا تَدْعُوا مَعَ اللَّهِ أَحَدًا ” (الجن:18) .
ومن هنا فإن وزارة الأوقاف تطالب بتغليظ العقوبة على من يستهدف دور العبادة بأعمال إرهابية ، أو من يتخذها منطلقا للأعمال الإرهابية ، أو يتجاوز في حقها أي تجاوز لا يتناسب مع حرمتها وقداستها وشرفها وطهارتها .